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name: Whole Exome Sequencing (WES) Analysis
description: 对遗传病患者、罕见病家系或不明原因疾病个体执行全外显子组测序（WES）分析，以高效识别蛋白质编码区的致病突变。当研究目标聚焦于编码区变异、预算有限且样本具备高质量DNA时使用本技能。
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# 全外显子组测序（WES）分析流程

## 适用场景
- 遗传病患者
- 罕见病家系
- 不明原因疾病个体

## 前提条件
- 高质量DNA样本
- 外显子捕获探针
- 高通量测序平台

## 执行步骤
1. **外显子富集**：使用杂交探针等序列捕获技术，从全基因组DNA中特异性富集所有外显子区域（约占人类基因组的1%）。
2. **高通量测序**：对富集后的DNA片段进行NGS测序，确保平均测序深度≥100×。
3. **序列比对与变异识别**：将测序读段比对至参考基因组（如GRCh38），识别单核苷酸变异（SNV）和插入缺失（InDel）。
4. **功能注释**：重点注释非同义突变、剪接位点突变、无义突变等可能影响蛋白质功能的变异。
5. **致病性评估**：结合ClinVar、HGMD等数据库及SIFT、PolyPhen等预测工具评估变异致病性。
6. **候选变异筛选**：在家系或队列中进行共分离分析，并过滤人群频率>1%的常见变异，锁定候选致病变异。

## 注意事项
- WES无法检测非编码区调控元件（如启动子、增强子）的变异。
- 可能遗漏结构变异或深内含子突变。
- 尽管外显子仅占基因组1%，但约85%已知致病突变位于此区域，因此WES在性价比和分析效率上具有优势。

## 输出结果
生成候选致病基因列表及变异位点，用于临床诊断、家系验证或后续功能实验。